―――果てなき混沌の穴の底で、機械少女は愛を育む
全てがセルで形成された大穴、ホド
いつ、なぜ始まったかさえ定かではない争いの渦は
人間が消えてもなお継続していた―――
上層のスパイであるエイジャは
中層の調査中に炭素生物（人間）の生体を発見する。

何万も昔に潰えた種のデータを採取するため
エイジャと炭素生物のいびつな生活が始まる。