廃都歴45年、都はヘドロに侵されたままだった。

魔巧使い、ニャロの仕事は単純。
ヘドロの掃除だ。
行き過ぎた化学開発によって生まれ、そして穢れをため込んだ産業廃棄物は意識を宿してしまった。

復讐か摂理か、人類がヘドロに飲まれたのは必然だった。

かといって、抗わないわけにもいかない。
人類は対抗手段を開発した。

それが魔巧使い、人類の希望だ。

かくして大人たちは、未来を彼女たち魔巧使いに託した。

──彼女たちが負けたとき、どうなるかを顧みずに...。