本作はオペレーションダークサイド:聖核戦姫壊滅作戦のDLCです。

悪の組織によって崩壊した聖核戦姫達…
逃げ延びた二人の聖核戦姫は仲間の救出を図り戦闘員として組織に潜入するが―――