彼女は初めて目にするイチモツを前に動揺を隠せずにいた。

「こ、これを…口に？…うう、試験のため…合格のため…よ、よーし…」
意を決して、生まれて初めてそれを口に含む彼女。
それは彼女の忘れられない長い夜の始まりだった…
舞台は20年ほど未来の日本。

医療用ナノマシンの普及と共に現れた、ハッキングされたナノマシン、「ナノマシンウィルス（=NW）」
人体に悪影響を及ぼすNWを秘密裏に処理すべく創設された特務機関「ナノキューブ」に一人のエージェント候補生がいた。

彼女の名は「鳴瀬
るな」